1Retratos de la memoria
Una noche, una luz se alzó hacia el cielo, anunciando la desaparición de Masami Saotome. Un mes después, en la escuela, Moto Tonomura, quien está enamorada de Saotome, escucha rumores sobre su aparición como fantasma. Esto la perturba profundamente, pero anhela verlo para expresarle su amor. Finalmente, Saotome aparece ante Moto, pero ya no como un ser humano.
2Luz en la oscuridad
Después de una noche en la que apareció una columna de luz, Hisashi Jounouchi comenzó a ver insectos en el corazón de las personas. Aquellos a quienes él les quitó esos insectos fueron liberados de cargas emocionales, ya que estos eran los recuerdos mismos de las personas. Hisashi los buscaba y devoraba, volviéndose adicto a ellos. Sin embargo, una oscura sombra se acerca hacia él...
3Los que aceptan el mundo - La vida puede ser tan agradable
Misuzu Arifuji es una chica amada por sus compañeros de clase, quienes la llaman "Panuru". Ella dice: "Acepto el mundo" y "Amo intensamente este mundo". Pero cuando Saotome y Boogiepop aparecen frente a Misuzu, su "amor por el mundo" comienza a distorsionarse. Porque ella no estaba aceptando realmente el mundo. Ella no era la verdadera "Panuru" después de todo...
4Mi bella dama - El amor hacia una chica pura
En estos días, está de moda un perfume llamado "Clase S". Yoji Suganuma es un joven obsesionado con su computadora, que se sumerge en el mundo de los videojuegos para escapar de la realidad. Cuando huele el aroma de "Clase S", la línea entre la realidad y la ficción se difumina. Y así, llega la noche en la que una columna de luz se alza hacia el cielo
5Interludio
En un rincón de la ciudad, yacía el cuerpo de una anciana en una mansión cubierta de enredaderas. La investigación policial reveló prendas para una niña, aunque no debería haber nadie más presente. Mientras tanto, Kazuko Suema visita el hospital, donde se encuentra con Toka Miyashita. Más tarde, el oficial Morita comparte con su colega los rumores sobre una organización que vigila el mundo...
6Ama a tu madre - Día de la Madre
Hace cinco años, Shizue Wakasa fue víctima de un asesino en serie. Rika, amiga de Shizue, entrega a su madre, Sachiko, un diario que compartió con ella. En sus páginas, se relata el tormento de Shizue, quien no soportaba ver a su madre con otro hombre y una aversión hacia el sexo como consecuencia. Mientras tanto, en la ciudad, ocurren frecuentes fenómenos de "resurgimiento del pasado"..
7Sin deseos insatisfechos - Hasta que estés en mis brazos nuevamente
Mamoru Oikawa era un joven apasionado por la creación. Solía hacer muñecos de madera para animar a su hermana pequeña, Sayoko, cuando se perdían juntos. Sin embargo, su perspectiva cambió al ver a su padre convertirse en un aislado social. Obsesionado con eliminar lo innecesario, su vida dio un giro la noche en que una luz apareció en el cielo, comenzando a eliminar lo que él deseaba...
8Su forma de vivir - Ella es tan inusual
Un día, aparece Ichiro Kishida ante Nagi Kirima, presentándose como un escritor. Nagi nota un parecido con alguien conocido del pasado. Para asegurar su colaboración en una entrevista, Kishida la sigue. Al ver la investigación de Nagi sobre los recientes casos de personas desaparecidas, se impresiona por su determinación. Con el tiempo, ambos descubren el núcleo de los extraños eventos.
9Pasado, presente y futuro - Nunca serás joven dos veces
Saki Yoshizawa, presionada por las expectativas de sus padres para convertirse en pianista, se desanima por los crueles comentarios de su profesora de música. En su desesperación, sigue una voz inesperada hasta el parque de atracciones "Paisley Park". Allí, Poom Poom aparece y le ofrece un globo rojo, haciendo que Saki se transforme en una niña feliz e inocente...
10Poom Poom
Akane Kojima se dirige a Paisley Park y conoce a un niño vestido como el flautista de Hamelín, a quien llama "Poom Poom", nombre de un personaje de un cuento que había escrito antes. Poom Poom declara: "Fuimos olvidados y abandonados. ¡Y este será nuestro país eterno!". Los amigos de Poom Poom juegan alegremente, pero muestran hostilidad hacia la llegada de Nagi Kirima.
11Arcoíris - Bajo el arcoíris de la gravedad
Manaka Kisaragi nació prematuramente a los cinco meses de embarazo. Criada en secreto por su abuela, Manaka creció de manera anormalmente rápida, superando en tamaño a varios niños de su edad e incluso a algunos adultos. Cinco años después, su abuela intenta terminar con su vida al darse cuenta de su propia muerte, pero ocurre un extraño acontecimiento en el cielo...
12Todo termina con el sueño - Un réquiem
Cuando todo parecía haber terminado, comenzaron extraños incidentes donde mujeres oficinistas morían repentinamente sin causa aparente. Mientras tanto, Ichiro Kishida recorría editoriales intentando publicar un reportaje sobre una misteriosa organización para ayudar a Nagi Kirima en su lucha. En un día particular, se encuentra nuevamente con el "Dios de la muerte", Boogiepop...