1Humancé
El grupo terrorista Alianza de Liberación Animal asalta un centro de investigación y se lleva a una chimpancé preñada. Quince años después, el humancé Charlie, híbrido de humano y chimpancé, se matricula en el instituto. Se hace amigo de Lucy, pero ninguno de ellos sabe lo frágil que es su apacible vida.
2ALA (Alianza de Liberación Animal)
La ALA ataca Nueva York y asesina a varias personas en un atentado. Cuando el pasado vínculo de Charlie con la ALA sale a la luz, en el pueblo sospechan de sus contactos terroristas. Sin inmutarse, Charlie va a clase, como de costumbre, sin sospechar lo que la ALA le tiene preparado. Mientras, un hombre misterioso se acerca a Lucy.
3Heterosis
Lucy visita a Eva, la chimpancé que dio a luz a Charlie, en el Instituto de Investigación de Primates Kornberg. Allí conoce a Fowler, que le cuenta varios secretos sobre el nacimiento de Charlie. Más tarde cena con la familia de Charlie y Hannah celebra que este haya hecho su primera amiga, pero no saben que la ALA está al acecho.
4Único
Charlie desaparece de pronto. Mientras Bert y Hannah lo buscan por todas partes, Charlie se enfrenta tranquilamente a Rivera, Lippman y Min-su, de la ALA. Les da un ultimátum y parece que van a llegar a un acuerdo, hasta que Rivera pega un cambio drástico.
5¿Una guerra por los derechos?
Charlie por fin es libre gracias a la ayuda de la senadora Dafne M. Linares, que aboga por los derechos de los animales. Sin embargo, cuando vuelve a clase, en vez de la cálida bienvenida que recibió en su día, sufre desprecios y calumnias. A pesar de todo, Lucy avanza en la obtención de derechos humanos para Charlie.
6Acción directa
Charlie vuelve a hacerse viral por detener una pelea entre Ozzy y el estudiante activista Gale. En vez de darle las gracias, Gale le pregunta por qué no muestra más pasión por los derechos de los animales. Decepcionado por la actitud de Charlie, Gale hace un directo sobre la impotencia de ser activista y recibe una misteriosa invitación.
7Red Pill
El alumnado es presa del pánico y el mundo observa con horror cómo un hombre enmascarado emite en directo el tiroteo a los estudiantes de Shrews. Philip Graham irrumpe en el centro y ve a Charlie ayudando a los heridos. Mientras, Lucy se enfrenta cara a cara al tirador y se prepara para enviarle en público un último mensaje a Charlie.
8La visita
El malestar público por el tiroteo lleva a un aumento de agresiones a veganos y activistas a nivel nacional. El sentimiento anti-ALA se intensifica, se difunde un bulo sobre que Charlie protegió al tirador y surge la confrontación con el resto del pueblo.
9En el castillo de Barba Azul
Lucy se topa con Phil y le cuenta la verdad sobre el incidente de la piscina de hace diez años. Phil se cuestiona su propia opinión sobre Charlie y Hannah percibe que algo ha cambiado en su hijo adoptivo. Esa noche, Lucy y Charlie se escriben. Pero una respuesta inusual por parte de Lucy hace que Charlie sospeche.
10Puerta al avance acelerado
Charlie acude solo a salvar a Lucy. Tras toparse con miembros armados de la ALA, Charlie encuentra a Lucy con Rivera. Fascinado por conocerlo en persona, Rivera le cuenta a Charlie la verdad sobre el asalto de la ALA para rescatar a Eva hace quince años y su relación con el doctor David Grossman, el padre biológico de Charlie.
11Transferencia de propiedad
Charlie returns after rescuing Lucy to find his home engulfed in flames. He rushes in to save his parents, but it is already too late. Realizing their deaths are suspicious, Charlie quickly disappears into the woods to evade police capture. A manhunt ensues as the authorities discover that Rivera has also gone missing from custody.
12Dimorfismo sexual
After losing his parents, Charlie is adopted by Deputy Phil and his wife Grace. They start a new life together despite the media frenzy and Phil's suspension for choosing to protect Charlie. However, more change is on the horizon for Charlie as his latest medical exams indicate his body is undergoing a transformation.
13Voluntad
As Charlie tries to return to a normal life, the nation is horrified to learn about the ALA's latest atrocity. Charlie seems to pay it no mind, though, and makes a visit to his biological mother Eva, who is on her deathbed. When Lucy finds a way to help Eva communicate, her final message for Charlie leaves everyone in shock.