1Abandonnés
L'assassinat d'un plombier de Brooklyn, apparemment ordinaire, lance l'équipe dans une enquête à l'échelle mondiale qui dérange la CIA. Pendant ce temps, Tiffany s'efforce de travailler sur le terrain après l'affaire Hakim.
2Trésor caché
L'équipe est sur l'affaire lorsqu'un couple de banlieue est assassiné et que toutes les preuves médico-légales pointent vers l'ancien propriétaire de la maison, qui purge actuellement une peine de 10 ans dans une prison fédérale. Pendant ce temps, OA retrouve un ancien collègue militaire et Scola tente d'accueillir un nouveau partenaire.
3Guerre de gangs
Après une série d'attentats ciblés dans le Queens, l'équipe craint qu'une guerre des gangs à l'échelle de la ville soit imminente, jusqu'à ce qu'un tuyau du vieux copain de l'armée d'OA, Clay, attire leur attention sur un ennemi inattendu et puissant. Pendant ce temps, Scola continue de se battre pour trouver un nouveau partenaire.
4La parole des femmes
Lorsque la sœur de Sydney Ortiz, profileuse de l'unité d'analyse comportementale du FBI, est victime d'une tentative d'enlèvement et d'agression sexuelle, Sydney demande l'aide d'Isobel et de l'équipe pour traquer un criminel en série méticuleux qui ne laisse aucune preuve derrière lui.
5Chacun ses priorités
Lorsqu'une manifestation sur un campus tourne au drame, l'équipe est appelée en renfort pour calmer le chaos et retrouver le meurtrier; pendant ce temps, Jubal s'inquiète lorsque Tyler se fait arrêter avec un groupe d'étudiants protestataires.
6L'épouse modèle
L'équipe traque un tueur en série après que les corps de plusieurs femmes ayant la même description physique ont été retrouvés éparpillés dans la ville; pendant ce temps, Maggie jongle avec ses rôles de tutrice d'Ella et d'agent du FBI.
7La théorie du complot
Après qu'un garde forestier a été abattu par un assaillant masqué, l'équipe découvre une série de crimes liés les uns aux autres qui les mènent à leur obstacle le plus difficile à ce jour: une communauté en ligne adepte des théories du complot.
8Un braquage en or
Après que trois douaniers ont été abattus lors d'un vol de marchandises, l'équipe confie à Clay, le vieux copain d'armée d'OA, le soin de déterminer s'il s'agit d'un coup monté de l'intérieur.
9Les ombres du passé
L'enquête sur la mort d'un procureur adjoint des États-Unis mène les membres de l'équipe à un scandale lié à un lanceur d'alerte d'une compagnie aérienne; ils ont peu de temps pour empêcher des terroristes de faire s'écraser des avions commerciaux.
10La chute
L'informateur confidentiel de longue date de Jubal apporte à l'équipe des informations sur une attaque terroriste imminente à grande échelle, mais lorsque les détails ne concordent pas, Jubal doit démêler la vérité d'un homme qui l'a connu dans ses pires moments.
11Trafic d'innocence
Lorsqu'un homme armé ouvre le feu dans un refuge pour sans-abri à Astoria, l'enquête mène l'équipe vers un tueur ayant des liens avec un cartel mexicain.
12Un pacte avec le diable
Lorsque leur opération d'infiltration dans le cadre d'un trafic sexuel tourne mal, l'équipe se précipite pour retrouver une victime de trafic humain; Maggie établit un lien avec un opérateur du 911 afin d'aider à localiser la jeune fille.
13La troisième cible
Deux jurés d'un procès contre la mafia sont abattus; l'équipe se lance dans une enquête sur le crime organisé; l'affaire prend une tournure personnelle pour Scola lorsqu'il apprend qu'un de ses anciens instructeurs pourrait être impliqué.
14Le train de l'enfer
Lorsqu'un train de passagers est détourné et redirigé à grande vitesse avec OA et Gemma, désarmés à bord, l'équipe se précipite à la recherche des auteurs déséquilibrés pour empêcher une catastrophe.
15Copycat
Alors que Maggie et l'équipe recherchent le dernier tueur en série de New York, la méthode d'imitation utilisée par le coupable oblige Bell à demander l'aide de Ray Distefano, un tueur en série qu'elle a mis derrière les barreaux.
16À découvert
Lorsqu'un agent du FBI sous couverture est tué sur le terrain, l'équipe découvre que les identités de plusieurs individus ont été compromises, y compris celle de Maggie, qui avait inflitré un groupe éco-terroriste. L'équipe fait alors appel à un agent dont la couverture a été divulguée, non seulement pour sauver l'un des leurs, mais aussi pour aider à découvrir qui est à l'origine de la fuite.
17Petits meurtres en famille
Lorsqu'un célèbre rappeur et deux de ses fans adolescents sont abattus dans son bus de tournée, l'équipe découvre que cela pourrait dépasser sa querelle avec un autre rappeur. Pendant ce temps, Isobel franchit une étape importante qui l'amène à envisager son avenir au Bureau.
18On récolte ce qu'on sème
Après que deux femmes ont été brutalement assassinées au napalm, Maggie et OA sont dirigés vers un site de rencontres où ils découvrent un groupe d'utilisateurs frustrés qui s'en prennent aux femmes qui les rejettent.
19Menace imminente
Après la disparition d'une jeune fille dans le Queens, l'équipe découvre que les kidnappeurs l'ont utilisée comme moyen de pression pour mener à bien un important vol d'explosifs, les envoyant à la recherche des dangereux coupables. Pendant ce temps, Scola et Dani commencent à travailler sur leurs bases en tant que partenaires.
20Start-up
Lorsqu'un PDG est tué dans une explosion ciblée à l'intérieur de son penthouse, l'équipe doit s'efforcer de comprendre comment quelqu'un a pu accéder au bâtiment hautement sécurisé. Leur tâche se complique lorsqu'ils découvrent que le crime pourrait être l'œuvre d'un programme d'intelligence artificielle. Pendant ce temps, Maggie freine sa vie personnelle.
21Adeptes
Lorsque deux agents spéciaux du fisc sont poignardés à mort à Brooklyn, l'équipe se lance dans une enquête qui la ramène à la résurgence de la communauté conspirationniste en ligne de Duke Ducoyle, qui fut suspecte dans une affaire précédente.
22Un jour nouveau
Après que Jubal a échappé de justesse à un assaut calculé contre un bureau secret du FBI, l'équipe découvre qu'un groupe terroriste a infiltré le FBI. Ne sachant plus à qui se fier, l'équipe doit travailler dans l'ombre pour démasquer les coupables qui menacent l'intégrité du bureau de New York.