1Partie 1
Par une chaude nuit de juin, Emanuela Orlandi, une ado du Vatican, disparaît. Des propos du pape Jean-Paul II et un étrange coup de téléphone viennent semer la confusion.
2Partie 2
Une piste prometteuse au Luxembourg ne mène nulle part. Dix ans plus tard, un lien surprenant entre le Vatican et la mafia italienne est révélé.
3Partie 3
Un homme prétend avoir orchestré l'enlèvement d'Emanuela. Mais alors qu'il enchaîne les révélations, sa crédibilité est remise en question.
4Partie 4
Après l'affaire Vatileaks, un journaliste découvre de nouvelles preuves qui semblent indiquer que le Vatican a caché des informations concernant le sort d'Emanuela.