1Réunion
Afin de trouver des réponses, le détective Mamoru Akasaka visite les ruines du village d'Hinamizawa 20 ans après la mort mystérieuse de ses habitants.
2Éveil du désastre — Chapitre 1 : Jeu du loup
Retour en juin 1983. Rika et Satoko arrivent tôt à l'école pour une journée riche en blagues, jeux et espièglerie avec Keiichi pour cible.
3Éveil du désastre — Chapitre 2 : Impuissance
D'étranges tensions voient le jour parmi les villageois avant le festival de Watanagashi. Satoko demande à Keiichi de prendre le poste de batteur à son match de baseball.
4Éveil du désastre — Chapitre 3 : Harmonie pré-établie
Alors que la plupart des membres du club profite du festival, Rika ne peut pas s'empêcher de penser à ce qui doit se produire selon ses prémonitions.
5Éveil du désastre — Chapitre 4 : Le Grand Désastre d'Hinamizawa
Le terrible jour arrive, et Rika cache Satoko dans le grenier avant la catastrophe. Satoko sort mais tombe dans une rivière par accident, ce qui la sauve.
6Le massacre — Chapitre 1 : Loi du labyrinthe
Dans un nouveau village Minamizawa, Rika décide de faire de son mieux pour empêcher ses amis de faire à nouveau les mêmes erreurs, mais les choses s'annoncent difficiles.
7Le massacre — Chapitre 2 : Comment changer le destin
Après avoir remarqué que ses amis avaient quelques souvenirs des cycles précédents, Rika espère que l'issue sera différente cette fois-ci.
8Le massacre — Chapitre 3 : Fluctuation
De retour, Teppei, l'oncle de Satoko, continue de la maltraiter. Rika et les autres font de leur mieux pour la sortir d'une terrible situation.
9Le massacre — Chapitre 4 : Résolution
Alors que le combat pour sauver Satoko se poursuit, Keiichi mobilise de nombreux villageois pour continuer de faire appel au gouvernement à son sujet.
10Le massacre — Chapitre 5 : Résolution finale
Keiichi décide d'assister à un conseil du village pour le mobiliser à la cause de Satoko, mais le jeune homme continue de recevoir des incitations à l'abandon.
11Le massacre — Chapitre 6 : La vérité
Alors que son violent oncle se tient tout près d'elle, Satoko reçoit un appel des services de protection de l'enfance à qui elle hésite à demander l'aide.
12Le massacre — Chapitre 7 : Le miracle
Cet arc continue avec son lot de révélations sur la mort et l'identité de Takano et Tomitake, le véritable objectif de la clinique Irie et plus encore.
13Le massacre — Chapitre 8 : Le dernier combat
La nuit tragique se produit à nouveau. Cette fois-ci, Rika et ses amis sont mieux préparés face aux mystérieux hommes qui ont perdu de leur mystère.
14Festival de meurtre — Chapitre 1 : Le début
Une série de flash-backs révèle que le Dr Takano a sorti Takano de l'orphelinat et l'a prise sous son aile et que sa recherche sur des parasites du cerveau la fascinait.
15Festival de meurtre — Chapitre 2 : Les deux vérités
Plus d'éléments du passé de Takano sont dévoilés, y compris sa rencontre avec le Dr Takano qu'elle a aidé et ses études studieuses pour poursuivre sa recherche.
16Festival de meurtre — Chapitre 3 : Le chemin
Les événements du barrage dont il est souvent fait allusion sont révélés ainsi que comment la clinique Irie s'est procurée un spécimen pour une recherche très spéciale.
17Festival de meurtre — Chapitre 4 : Le combat
Satoko reste gravement atteinte du syndrome d'Hinamizawa. Rika découvre qu'elle pourrait détenir la clé d'un remède et se porte volontaire pour faire l'objet d'une étude.
18Festival de meurtre — Chapitre 5 : La bataille
Les origines du club sont révélées et les personnages principaux se rassemblent. Satoshi fait mine de ne pas s'inquiéter pour sa sœur mais montre des signes de paranoïa.
19Festival de meurtre — Chapitre 6 : Le commencement
Hanyu se présente au village où elle intègre l'école et rejoint le club avec pour intention d'aider les autres.
20Festival de meurtre — Chapitre 7 : Le choix
Avec l'aide d'Oishi, Rika recrute le Dr Irie et Tomitake pour rassembler des informations sur Takano et est confortée par l'enthousiasme de ses amis.
21Festival de meurtre — Chapitre 8 : La fin
Le plan de Takano est contrarié par la "mort" de Rika soigneusement simulée par une grande coalition de personnages.
22Festival de meurtre — Chapitre 9 : Le miracle
Sous les ordres de Takano, les Yamainu se lancent à la poursuite de Tomitake et du Dr Irie et parviennent à glaner d'importantes informations.
23Festival de meurtre — Chapitre 10 : Le monde
Alors qu'elle interroge Tomitake, Takano reçoit des nouvelles de Rika. Elle décide alors de se mobiliser sur le front afin d'assurer le succès de son opération.
24Festival de meurtre — Chapitre 11 : La dernière pièce
Akasaka et Tomitake s'enfuient et font appel à l'unité de combat d'élite Banken pour les aider. Takano et le club se retrouvent au cours d'un affrontement final.