1A estrela cadente que a garota viu
Cinco pilotos e seus Gundams são enviados para a Terra na chamada Operação Meteoro. Quatro deles conseguem entrar no planeta sem problemas, mas um deles, Heero Yuy, é interceptado.
2O Gundam chamado Deus da Morte
Relena se recusa a acreditar que Heero é mal como parece e insiste em saber mais sobre ele. Duo Maxwell aparece com seu Gundam.
3Cinco Gundams confirmados
Zechs Merquise e as forças da Organização OZ conseguem confirmar que cinco Gundams aterrissaram na Terra e agora dão início a ataques terroristas em instalações militares.
4O pesadelo de Vitória
Zechs chega à base da OZ no lago Vitória para inspecionar as tropas e reencontrar uma velha amiga. Mas logo começam a sofrer um ataque de um Gundam.
5O segredo de Relena
Relena e seu pai viajam até as colônias para tentar evitar que uma guerra aconteça. No entanto, um atentado fere gravemente seu pai e o força a contar quem Relena é na verdade.
6Noite de festa
A festa de aniversário de Relena é arruinada pelas forças especiais da OZ, que a querem morta. No meio do caos, ela recebe ajuda de alguém inesperado.
7Enredo sangrento
Os pilotos dos Gundams fazem um ataque à base New Edward, onde supostamente estariam reunidos os membros de elite das forças da organização OZ. Mas tudo era uma grande armadilha que mudaria totalmente o destino dos jovens pilotos.
8O assassinato de Treize
O próximo alvo de Lady Une são os Gundams e ativa o sistema de auto-destruição na base New Edwards. Os pilotos dos Gundams tentar evitar a explosão e ir atrás de quem armou tudo isso.
9O retrato de um país arruinado
A Aliança da Esfera Terrestre Unida entra em colapso, deixando o planeta em pânico. Heero e Duo continuam sua luta contra a OZ, enquanto Zechs vasculha as ruínas do Reino de Sanc.
10Heero, distraído pela derrota
Lady Une usa suas tropas para outra estratégia na tentativa para eliminar os Gundams. Em outro local, o Gundam Wing e o mobile suit Tallgeese se encontram no campo de batalha.
11Os arredores da felicidade
Guiado por Quatre, Duo se refugia na base da divisão Maganac. Inspirados pelas ações de Heero, os garotos começam a discutir o que farão em seguida. Enquanto isso, Relena vai à Moscou, ela está prestes a ter sucesso na perseguição da assassina de seu pai.
12Guerreiros confusos
Wu Fei e Sally Po se encontram mais uma vez no campo de batalha. Ele está confuso pelas emoções que ele sente, não consegue compreender qual a sua razão para continuar sua luta.
13As lágrimas de Catherine
Zechs já consegue controlar seu novo mobile suit, Tallgeese e se oferece para participar de uma missão de ataque, mas os seus piores inimigos acabam sendo jovens oficiais da OZ que começam a agir de acordo com suas vontades. Trowa decidiu fazer uma armadilha para os soldados das forças da OZ, envolvendo Catherine e seus companheiros em uma luta feroz.
14A ordem para destruir 01
Após cometer um grande erro, tenta arranjar uma forma para compensar isso. Relena ainda tenta convencer as pessoas de qual é a melhor forma de conseguir a paz. Enquanto isso, Zechs recebe novas ordens da Fundação Romefeller.
15Para o campo de batalha, Antártida
Heero é convidado para ir até a Antártida, onde Zechs o espera. Lá, Heero descobre que seu Gundam foi restaurado e servirá para que ele e Zechs consigam terminar a batalha entre eles que foi interrompida no último encontro.
16Uma batalha triste
Zechs aguardava ansioso para ter seu duelo com Heero. A luta começa, mas Relena aparece e sem saber quem é realmente Zechs Merquise, pede para que Heero o mate.
17Traídos pelo lar distante
OZ age para destruir a Aliança Militar de uma vez por todas. Quatre e Duo seguem para alertar as colônias, mas acabam descobrindo que agora os Gundams são considerados inimigos.
18Tallgeese destruído
A batalha entre Tallgeese e o Gundam é concluída. Quatre fica ferido e Zechs se recusa a lutar pela Fundação Romefeller, tendo agora que passar por um teste mortal.
19Ataque à Barge
O Gundam Deathscythe enfrenta os mobile suits da OZ no espaço, mas Duo acaba sendo capturado. Seguindo seu instinto de soldado, Heero parte para eliminar Duo, para manter os segredos dos Gundams e seus pilotos.
20Infiltrando na base lunar
A organização OZ está desenvolvendo nos mobile suits. Heero Se infiltra na base lunar para sabotar essa operação, mas acaba surpreso ao encontrar uma certa pessoa conhecida trabalhando ali.
21Quatre, abatido pela tristeza
Um mobile suit branco se aproxima da colônia e Lady Une ordena que ele seja destruído. Enquanto isso, Quatre volta para sua casa e reencontra com sua família, mas não iria demorar para que uma das maiores tragédias de sua vida acontecesse.
22A luta pela independência
As colônias começam a se armar, se preparando para a guerra. Lady Une sai para enfrentar uma batalha e logo decide ir contra as ordens da Fundação Romefeller.
23Duo, o deus da morte, mais uma vez
Na tentativa de interromper a produção das novas máquinas de guerra da OZ, Duo segue para a lua e destruir a base.
24O Gundam chamado zero
Um novo Gundam aparece e mostra que possui muito mais poder do que os Gundams anteriores. Após destruir um satélite de recursos naturais, o inimigo desconhecido parte para atacar uma das colônias. Trowa e Heero partem para evitar mais destruição.
25Quatre vs. Heero
O novo e poderoso inimigo era Quatre, que não parece estar agindo de forma consciente, insistindo em querer destruir uma colônia inteira. Herro deve tentar detê-lo a qualquer custo.
26A chama eterna da estrela cadente
Na tentativa para libertar Treize, os soldados leais a ele dão início a uma batalha contra a Fundação Romefeller. Enquanto isso, desta vez é Heero quem vai sofrer com os efeitos do sistema Zero do Gundam que Quatre pilotava descontroladamente.
27A tragetória da vitória e da derrota
Relena pensa sobre os eventos passados e fica cada vez mais determinada a colocar um fim na tirania da Fundação Romefeller.
28Destinos que se cruzam
Mesmo que esteja fora do campo de batalha, Treize continua a seguir seus planos, forçando as pessoas ao seu redor a fazer escolhas e sacrifícios.
29A heroína do campo de batalha
Heero e Quatre retornam à Terra e se tornam alvos da Fundação Romefeller. Enquanto isso, Noin e Sally trabalham para encontrar os Gundams e seus pilotos.
30O reencontro com Relena
Heero luta agora junto dos soldados da Facção Treize e tenta deter o crescente abuso de poder dos soldados da Romefeller. Relena continua seus planos pelo Reino de Sanc e Quatre convence Heero para proteger o reino de Relena.
31O reino de vidro
Heero e Quatre decidem ficar no Reino de Sanc e ajudar Relena a promover o pacifismo, mas os soldados da Fundação Romefeller formulam um plano para conseguirem entrar no reino e armar uma guerra e anular os ideias de pacifismo total que Relena tenta disseminar.
32O Deus da Morte encontra Zero
Ainda no espaço, Duo se mantém combatendo as forças da nova OZ. Mas algo inesperado acontece, ele é forçado a usar o Wing Zero para servir como fonte de dados de batalha.
33Campo de batalha solitário
Relena é convidada para uma reunião com a Fundação Romefeller e discutir suas ideias para um futuro de paz. Mas ela logo se vê acusada de não seguir suas próprias crenças ao permitir que seu irmão lute contra a OZ.
34Seu nome é Epyon
Heero se encontra com Treize, que deixa nas mãos do jovem piloto um novo modelo de Gundam. Enquanto isso, Zechs agora pilota o Wing Gundam Zero, que segue eliminado as forças da nova OZ.
35O retorno de Wu Fei
Zechs tenta se juntar aos pilotos dos Gundams e vai ao encontro de Wu Fei, que está mais decidido a combater sozinho todos os que ele considerar como inimigo, agora ele escolheu não confiar em mais ninguém.
36O colápso do Reino de Sanc
Duo finalmente volta a encontrar Trowa, mas ele não está em condições para voltar a ser um piloto. Falta pouco para que a nova nave gigante de guerra da Romefeller esteja terminada, mas antes disso, o Reino de Sanc deve ser eliminado para que deixe de ser um obstáculo para a tomada total de poder da fundação.
37Zero vs. Epyon
Relena se rendeu à Romefeller, oferecendo a ela uma escolha difícil. Logo em seguida, um novo grupo rebelde nascido nas colônias começa a agir de forma independente.
38O nascimento da rainha Relena
Um grupo armado das colônias chamados de Presas Brancas começam a tomada das bases da OZ. Quatre e Noin estão à procura dos outros pilotos dos Gundams e a Fundação Romefeller fez com que Relena se torne sua representante.
39Trowa retorna ao campo de batalha
O líder do novo grupo rebelde entra em contato com Zechs e pede para que ele leve seu Gundam ao espaço sideral. Trowa ainda sofre de amnésia mas já está de volta para continuar a ajudar os outros pilotos.
40Um novo líder
Heero planeja eliminar o líder da Fundação Romefeller, enquanto Relena dá seus primeiros passos para chegar à verdadeira paz no mundo. Milliardo Peacecraft se torna o novo líder das Presas Brancas e se torna uma ameaça a todos.
41Fogo cruzado na Barge
Treize volta para tomar o controle da Romefeller e da OZ. Ele tem outros planos para Relena e a dispensa de sua posição como rainha.
42Nave de guerra Libra
Wu Fei segue sua luta solitária. Na Terra, Treize une suas forças militares para enfrentar as Presas Brancas e a nave Libra, a gigante de guerra recém terminada que avança em direção da Terra.
43Alvo: Terra
O grupo rebelde Presas Brancas está cada vez mais poderosa, e seu líder, Milliardo Peacecraft planeja disparar o canhão principal de sua nave Libra, o que pode causar a destruição de uma das colônias.
44Avante, equipe Gundam
Relena embarca na nave Libra. Enquanto isso, mobile dolls atacam os pilotos dos Gundams, mas agora as máquinas autônomas estão com um novo programa de batalha e se toram oponentes formidáveis.
45Sinais da batalha final
Hilde se infiltra na nave Libra e rouba dados valiosos, mas logo é descoberta e perseguida. Isso será útil para Heero e seus companheiros que estão sofrendo pelos ataques sucessivos e desgastantes.
46A decisão de Milliardo
Heero consegue entrar na nave Libra e encontra Relena. Juntos vão à procura de Milliardo. As forças de Treize estão prontas para o ataque contra as Presas Brancas, mas ele decide desafiar somente Milliardo para um duelo e evitar a guerra.
47Colisão no espaço
Libra se recusa a mudar sua rota em direção para a Terra. O plano que surge é colocar a nave Peacemillion em rota de colisão para interceptar a nave inimiga e desviar sua rota à força.
48Decolagem para a confusão
O plano de colidir a nave Libra contra a Terra continua. Wu Fei volta a ter uma nova chance de duelar contra Treize, o que levou a uma reviravolta na guerra.
49O vencedor final
Relena e os outros lutam para tentar evitar que as naves Libra e Peacemillion caiam na Terra. Heero e Zechs travam sua última e decisiva batalha.