1O Começo do Desastre
Sonic não conseguiu retornar ao seu mundo. Enquanto isso, Eggman está trabalhando para desenvolver uma série de robôs.
2A Misteriosa Forma de Vida Líquida, Chaos
Tails e Sonic estão em busca de uma Esmeralda do Caos. Knuckles relembra importantes acontecimentos do passado.
3Amy, A Enclausurada
Sonic e Tails partem em busca de Amy para resgatá-la. Eggman ordena que os robôs capturem Froggy.
4Batalha no Egg Cargueiro
Knuckles, Sonic e Tails se infiltram no Egg Cargueiro e tentam encontrar a peça que falta da Esmeralda Mestre.
5Gama, o Andarilho
Tails salva a Station Square e vira um herói. Nas ruínas, Sonic encontra a luz misteriosa que o leva ao passado.
6O Grito do Perfect Chaos
Eggman deseja se vingar da traição de Caos. Enquanto isso, Knuckles e Sonic são transportados para o passado.
7O Quebra-Cabeça do Projeto Sombra
Eggman descobre a existência do projeto Sombra, uma operação secreta para desenvolver a criatura perfeita.
8Sonic, o Fugitivo
Sonic é acusado de roubar uma Esmeralda do Caos e unir forças com o inimigo. Agora ele corre o risco de ser preso e julgado por traição.
9Escape da Ilha Prisão
Sonic está detido em uma prisão de segurança máxima na Ilha. Tails, Chris e Amy tentam libertá-lo.
10Uma Ameaça do Espaço Exterior
Depois que a prisão da ilha é destruída, Sonic sai à procura de Chris, mas não o encontra. Dr. Eggman está envolvido nesse sumiço.
11A Batalha Da Colônia Espacial, ARK
Sonic e Sombra se enfrentam enquanto o resto da tripulação procura Dr. Eggman. Knuckles e Rouge brigam pelo controle da Esmeralda Mestre.
12Desejo de Maria, Desejo de Todos
Dr. Robotnik planeja como vingança colidir a ARK com a terra e destruir tudo! Agora, Sonic precisa convencer Sombra a salvar o mundo.
13A Agência de Detetives Chaotix
Aves misteriosas chamadas Flickies aparecem na Terra. O presidente precisa agir para evitar que a presença delas vire um problema entre as espécies.
14Corporação Eggman
Todos aguardam a chegada do ano novo para assistirem ao primeiro nascer do sol. Eggman tem planos para interromper esse momento.
15A Luz É Nossa!
Sonic é suspeito de interromper o fornecimento de luz solar de Eggman. O presidente envia as Forças para capturá-lo.
16Amy, Jornada de Fuga do Amor?!
Sonic não aparece no encontro com Amy, e ela decide sair com Sam. Enquanto isso, Bokkun ajuda a tirar Eggman da cadeia.
17Enorme Pânico dos Eletrodomésticos
O pai de Chris descobre que a maioria de seus funcionários está seguindo Sonic e abandonando o emprego. Direto da prisão, Eggman cria uma armadilha para o ouriço.
18A Ridícula Batalha Espiã Épica
Após Eggman ser solto, Stewart procura por ele nos esgotos, mas acaba sendo capturado.
19Sonic Battle: Abertura!!
Para atrair Eggman, o presidente cria um torneio que tem como prêmio uma Esmeralda do Caos. Sonic, seus amigos e alguns servos de Eggman participam da competição.
20Sonic Battle: Final!!
Emerl vence a luta final contra Knuckles e ganha uma Esmeralda do Caos. O problema é que ele enlouquece e destrói a cidade.
21Batalha Decisiva no Equador
Knuckles tem um mapa antigo que mostra um continente perdido. Eggman logo descobre e tenta roubar o mapa.
22Sonic Contra Um Monstro do Subterrâneo
Sonic e seus amigos estão à procura de Eggman. No meio do caminho, eles encontram as ruínas da Murasia e descobrem um mundo subterrâneo.
23O Dia que a Terra Parou
Desde que Sonic chegou à Terra, os dois mundos estão se aproximando e quando se unirem, o tempo vai parar. O ouriço precisa retornar ao seu mundo antes disso.
24Manhã de Despedidas
Chris passa os últimos dias com Sonic e seus amigos. O presidente decide capturar Eggman.
25A Longa Jornada de Chris
Chris não aceita que Sonic tenha que partir. Ele sai correndo com o ouriço e todos começam a procurá-los.
26Memórias do Vento
Todos estão de volta em seus mundos e tudo parece normal como antes. Mas ninguém sabe onde está Sonic.