1O Valor de um Homem (Parte 1)
Bishop e Shard voltam no tempo na tentativa de impedir o surgimento de um futuro alternativo onde os X-Men jamais existiram.
2O Valor de um Homem (Parte 2)
Ao falhar na tentativa de impedir o assassinato de Xavier, Tempestade convence Wolverine que devem ajudar Shard e Bishop a garantir que o Professor Xavier viva.
3Coragem
A festa para comemorar a volta de Morfo aos X-Men é interrompida quando terrorista atacam uma fábrica de armas de alta tecnologia. Wolverine e Morfo descobrem que os sentinelas estavam de volta à ativa. O X-Man desgarrado terá que enfrentar seus próprios medos para vencer os robôs caçadores de mutantes.
4Proteus (Parte 1)
Quando o mutante Proteus descobre que seu próprio pai, que havia o abandonado no passado, é um importante político, ele o ataca bem no meio de seu discurso. Xavier entra na parada para tentar conter Proteus e ainda ajudar o garoto, cujo nome real é Kevin, a se reconciliar com seu pai.
5Proteus (Parte 2)
Xavier ajuda Moira MacTaggert para deter seu filho Proteus, cujo nome verdadeiro é Kevin, para tentar contê-lo e ainda ajudar o garoto a se reconciliar com seu pai, mais está muito difícil e Proteus está chegando perto de seu pai Joe MacTaggert.
6O Santuário (Parte 1)
Magneto oferece levar todos os mutantes para um asteroide onde poderão viver em paz. Mas diversos governantes globais ficam preocupados com o plano e resolvem explodir o local. Ao descobrir tal plano, Charles Xavier decide intervir e, com a ajuda de Fera e Gambit, os três vão ao encontro de Magneto no asteroide, mas acabam sendo acusados de assassinar Magnus.
7O Santuário (Parte 2)
Com o desaparecimento de Magneto, Fabian Cortez assume o controle do Asteroide M e passa a manter a Terra como refém sob a mira de um incrível arsenal de armas nucleares. Os X-Men terão que provar a sua inocência, encontrar Magneto e impedir Cortez de destruir o mundo.
8Acima do Bem e do Mal (Parte 1)
Em 3999, Apocalipse derrota Cable e rouba-lhe o computador que permite viajar no tempo. Bem no dia da segunda tentativa de casamento de Jean e Scott, Sr. Sinistro e os Nasty Boys sequestram a noiva. Enquanto isso, Bishop fica preso numa fenda temporal. Sua irmã, Shard, vai em seu socorro mas vai parar na Mansão X.
9Acima do Bem e do Mal (Parte 2)
Na verdade, Apocalipse e seus aliados malignos (Carrascos e Irmandade) estavam querendo criar uma nova raça de humanos. O Professor Xavier descobre o plano ao perceber que todos os mutantes sequestrados tinham poderes psíquicos. O problema era saber onde o vilão estava e como chegar até ele para detê-lo.
10Acima do Bem e do Mal (Parte 3)
Com a ajuda de Cable, os X-Men descobrem que Apocalipse estava controlando o tempo.
11Acima do Bem e do Mal (Parte 4)
Quando o plano de Apocalipse se torna conhecido por todos, até mesmos seus aliados (Irmandade de Mutantes) tentam impedi-lo de seguir em frente. Mas será que os X-Men e os demais mutantes conseguirão salvar o tempo e o universo de Apocalipse e Sinistro?
12Passando o Natal com os Morlocks
Jubileu, Tempestade e Wolverine fazem compras de última hora em Manhattan.
13A Lotus e o Aço
Wolverine perde o controle, desiste dos X-Men e volta ao interior do Japão.
14A Perda de um Amor
No deserto do Novo México, Wolverine testemunha a queda de uma nave.
15Segredos Revelados
Ciclope viaja sozinho para uma pequena comunidade no deserto.
16Lembranças de Xavier
O Professor X sofre uma concussão que o deixa vulnerável à manipulação.
17Laços de Família
Alto Evolucionário rapta Mercúrio, Fera, Wolverine e Feiticeira Escarlate.