1Qui flashe, part en délire
King Julien photographie Maurice et il disparait. Il croit que Maurice est enfermé dans l'appareil photo. Les Pingouins pensent le contraire et partent à sa recherche.
2Décollage immédiat
Les pingouins construisent une fusée pour aller sur la Lune. Hélas, une erreur de calcul va les diriger vers le sommet d'un immeuble ou vit un chat un peu bizarre.
3Terrier hanté
La nouvelle du Zoo, Marlène, rencontre les pingouins pour la première fois.
4Opération sauvez Morty
Quand le zoo sort des jouets à l'effigie de Morty, Julian devient jaloux et s'arrange pour qu'ils soient ré-expédiés. L'ennui, c'est que Morty est également ré-expédié !
5L'anniversaire du Roi Julian
Une fête est organisée pour le "Jour du Roi Julian". Hélas, il faut que Maurice appâtent les convives et Skipper ne semble pas intéressé.
6Un œuf surprise
Marlène a besoin d'aide pour garder des œufs...
7Grosse bagarre pour une pile
Vu que Julian refuse d'éteindre sa radio, Skipper décide de s'introduire chez lui et de lui dérober ses piles.
8Capturez le drapeau !
Les pingouins et les lémuriens s'engagent dans un jeu de "capture du drapeau".
9Pas touche aux pieds !
Après que Morty ait accidentellement détruit le fauteuil volant de Julian, celui-ci décrète une nouvelle loi : quiconque lui touchera un pied sera banni. Malheureusement, en dormant, Morty va commettre l'irréparable.
10Un boulet sur le web
Quand des webcams sont installées un peu partout, les pingouins refusent cette nouvelle situation.
11Un accroc pour une couronne
Quand le Roi Julian perd sa couronne, Skipper est envoyé pour la retrouver. Pendant ce temps, Marlène est chargée de le calmer.
12Question d'instinct !
Marlène et Mort rendent visitent à leurs nouveaux voisins du zoo, mais ces derniers capturent Mort.
13Les noix de lychees
Quand le Roi Julian est emmené à l'infirmerie à cause d'un comportement pire que d'habitude, Maurice prend les choses en main. Mais le pouvoir ne risque-t-il pas de lui monter à la tête ?
14Coincé dans le gosier
Rico est connu pour sa capacité à extraire tout et n'importe quoi de son estomac, mais un jour un gardien va lui donner un médicament contrant cet effet. Problème : il y a une bombe à retardement dans son ventre.
15Le Grand Prix
Les pingouins s'amusent autour du zoo dans leur jolie voiture rose. Les ennuis commencent quand le Roi Julian veut conduire sa propre voiture. Ceci débouche inévitablement sur une course !
16Pop-corn Panique
Une enfant, prénommée Alice, se fait attraper par la gardienne du zoo en donnant du popcorn à Marlène. Les visiteurs n'ont pas le droit de donner du popcorn parce qu'ils ont un régime alimentaire strict. King Julien veut se débarrasser d'Alice mais les pingouins ne sont pas d'accord alors ils vont en mission pour retrouver du popcorn.
17Gros bêtas !
Les pingouins font leur cinéma pour engager les visiteurs à leur acheter le poisson d'Alice. Le Roi Julian n'entend pas supporter plus longtemps cette odeur.
18Gloire sur la glace
Il gèle chez les pingouins, alors ils décident de faire du hockey sur glace. Ils sont défiés par la bande des rats (Crown Fools).
19L'éclipse
Mason et Phil en ont assez de se faire embêté par les lémures. Apprenant qu'une éclipse de soleil va se produire, ils préparent une blague au Roi Julien.
20Visite chez le docteur
Skipper échappe au vétérinaire pour éviter une piqure. Les pingouins tentent de l'y forcer, mais il fait preuve de nombreuses ressources.
21Morty, super musclé
Suite à une expérience ratée de Kowalski, Morty quadruple de taille. Quand Julian réalise l'incroyable force de Morty, il décide d'en tirer partie.
22La colocataire
Marlène amène une nouvelle colocataire pour Rondha. Cette morse est très encombrante et a de très mauvaise manières !
23Biscuit de la bonne fortune
Les animaux du zoo commandent à manger au restaurant Chinois. Tous les pingouins lisent le message caché dans leur biscuit de la bonne fortune.
24Le Lem-R
Un robot de l'espace est envoyé dans le zoo pour apprendre les méthodes du Roi Julian.
25Roger, chanteur !
Le roi des rats terrorise Roger, l'alligator et ami des pingouins (Terrier hanté).
26L'orque dans le ciel
Private aperçoit un orque dans le ciel. Seulement personne ne le croit.
27L'instinct sauvage de la loutre
Quand les pingouins emmènent Marlène en "mission" dans le parc, elle ne supporte pas de se retrouver en liberté, son instinct prend le dessus.
28Chat errant
Max, le chat, s'est enfui du contrôle animal de l'Officier X et demande l'aide des pingouins. Le zoo est verrouillé, les pingouins acceptent la mission.
29Singerie d'amour
Une femelle chimpanzé appelée Lulu est transférée au zoo.
30Verrouillés
Un curieux scientifique interrompt les pingouins en pleine opération (pour réchauffer le zoo, où il fait un froid de canard)…
31Le bon moment
Une petite fille perd sa poupée au zoo, et Rico est convaincu qu'il doit lui donner sa propre poupée pour la remplacer.
32Robin des villes
Un mystérieux bandit prive les animaux du zoo de leurs possessions les plus chères.
33Groove en pot !
Julian est horrifié de voir que la chorégraphie des babouins attire plus d'attention que la sienne.
34La loi de la jungle
Une panne d'électricité au zoo élève les désillusions de grandeur du Roi Julian vers un tout autre niveau.
35Le zombie du Commandant
Les autres pingouins ont peur que Commandant ne se transforme en zombie après une visite chez le vétérinaire.
36Le nid de frelons
Des frelons peu sympathiques ont l'intention de piquer tous les visiteurs du zoo.
37Grandeur et décadence
Après un incident avec Julian, Maurice et Morty sont bannis de son royaume.
38Intouchables
Une toute petite grenouille au comportement épouvantable déménage au zoo et commence à terroriser les autres animaux.
39Phil et Mason
Après une dispute, les pingouins montrent à Mason et Phil combien ils ont besoin l'un de l'autre.
40Les plus et les moins
Commandant a une crise identitaire lorsqu'Alice mentionne qu'un des pingouins est en fait une femelle.
41Un éléphant n'oublie jamais
Burt l'éléphant demande aux pingouins de l'aider à s'enfuir du zoo.
42Le trouve-amour
Marlène aperçoit Fred l'écureuil et en tombe immédiatement amoureuse.
43CAC
Les animaux filment une publicité pour faire la promotion du zoo lorsqu'une nouvelle chaîne de TV les rend obsolètes.
44La truite tête de serpent
Lorsqu'un poisson géant terrorise une mare à canards, Commandant mène une mission pour éliminer la menace.
45Tremblotte
Kowalski donne accidentellement vie à une masse de gelée… qui a très faim.
46Mademoiselle Kitka
Lorsqu'une magnifique faucon atterrit dans le zoo, Commandant insiste pour qu'elle y reste.
47Le photographe
P'tit gars est en colère contre Morty quand celui-ci est choisi pour faire la couverture animale de la brochure du zoo.
48La revanche du Docteur Blowhole
Le Dr Blowhole, l'ennemi juré des pingouins, a kidnappé le Roi Julian. Ils doivent intervenir avant que son plan machiavélique ne soit mis à exécution.