1Darkness Rising – Parte 1
Optimus Prime e os Autobots investigam o retorno dos Decepticons enquanto precisam dar conta de um grupo de jovens humanos.
2Darkness Rising – Parte 2
Quando um sinal é recebido de Cliffjumper, os Autobots encontram Megatron, que obteve uma substância misteriosa e poderosa.
3Darkness Rising – Parte 3
Bulkhead está em missão para resgatar o Agente Fowler que foi sequestrado pelos Decepticons. As coisas ficam complicadas quando Miko se junta a ele secretamente.
4Darkness Rising – Parte 4
Megatron convoca um exército de guerreiros mortos-vivos para combater o Optimus, enquanto os outros Autobots fazem um resgate de alto risco a bordo de um navio de guerra.
5Darkness Rising – Parte 5
Auxiliados pelo exército de mortos-vivos de Megatron, os Decepticons lutam contra os Autobots. O destino da Terra está em jogo!
6Alunos & Mestres
Enquanto Optimus Prime e Bumblebee se enfrentam contra Skyquake, Starscream passa por desafios em sua liderança.
7O Ferro Velho
Bulkhead, Bumblebee e Ratchet lutam para eliminar um grupo de Scraplets que invadiram a base de Autobot. Enquanto isso, Optimus e Arcee patrulham na região do Ártico.
8A Tramoia
Bulkhead aguarda ansioso a visita de seu velho amigo Wheeljack, mas quando seu colega chega, as coisas não são tão simples.
9O Comboio
Os Autobots ajudam o Agente Fowler no transporte de um dispositivo perigoso, mas acabam sendo atacados durante a missão.
10O Deus da Máquina
Miko e Bulkhead embarcam em uma viagem para recuperar uma colhedora de Energon.
11O Racha
Tentando impressionar uma garota e se vingar do valentão da escola, Jack convence Bumblebee a ajudá-lo a vencer uma corrida. Mas o plano sai de controle com a chegada de Knock Out.
12Destruidor
Arcee leva Jack em uma missão de rotina, mas Arcee se depara com um arqui-inimigo e precisa enfrentar seus medos mais profundos.
13Mente Doente
Optimus Prime é infectado por uma praga Decepticon. Arcee e Bumblebee se escondem a bordo de uma nave de guerra para encontrar a fórmula da cura.
14Fora de Sí
Megatron se instala na mente de Bumblebee e manipula suas ações na base Autobot.
15Shadowzone
Os garotos ficam presos em uma dimensão alternativa. Para piorar as coisas, eles estão confinados com um Skyquake.
16Operação: Breakdown
Os Autobots tentam resgatar Breakdown, o Decepticon que foi sequestrado por Silas e agentes da MECH.
17Dupla Atração
Airachnid negocia um acordo com Silas para usar MECH e se vingar de Arcee e Jack.
18Atração Metálica
Arcee e Bulkhead reúnem esforços para parar uma missão Decepticon. Um dispositivo magnético os força a trabalhar em equipe.
19Rock Bottom
Com Jack e Miko, os Autobots são vítimas de uma mina de Energon e se veem presos com Starscream e Megatron.
20Parceiros
Airachnid e Starscream são forçados a recuperar uma arma poderosa. Ao ser capturado por Optimus e equipe, Starscream revela que preferiria se unir aos Autobots.
21T.M.I.
Quando o cérebro de Bulkhead é acidentalmente contaminado pela fórmula secreta de Energon, ele fica recluso. Enquanto isso, os Decepticons saem à caça.
22Mais Forte e Mais Rápido
Ao fazer experiências com Energon sintético, Ratchet se torna uma ameaça aos Deceptions...Mas também aos Autobots e a ele mesmo.
23Um Deverá se Render
A tentativa de Megatron de cumprir uma antiga profecia fere um de nossos heróis e dá início a uma revanche há muito aguardada.
24Um Deverá Subir - Parte 1
Os Decepticons colhem a recompensa de Dark Energon. Enquanto isso, os Autobots descobrem qual a causa das terríveis erupções.
25Um Deverá Subir - Parte 2
Optimus Prime e os Autobots procuram uma maneira de destruir Unicron sem destruir a própria Terra. O maior aliado deles pode ser o mais inesperado.
26Um Deverá Subir - Parte 3
Optimus e Megatron batalham para entrar no centro da Terra, onde deverão derrotar Unicron antes que ele acorde e destrua a humanidade.